一、安全发酵
（一）电石、各种刚喷洒了剧毒农药的作物茎叶、刚消毒的禽畜（鸡、兔等）粪便，都不能进入沼气池，以防厌氧细菌受到破坏。如发生这种情况，就将池内发酵料液全部清除，并用清水将沼气池冲洗干净，然后再重新加料。
（二）禁止把油枯、骨粉、棉籽饼和磷矿粉加入沼气池内，以防产生对人体有严重危害的剧毒气体。
二、安全管理
（一）沼气池的进、出料口要加盖，防止人、畜掉进池内，造成伤亡。
（二）要经常观察压力表上水柱的变化。当池子产气旺盛，池内压力过大时，要立即用气或放气，以防胀坏气箱，冲开池盖。使用直管压力表时，当压力达到一定限度时，多余的沼气就从压力表的玻管下端排走，可避免冲开池盖。如池盖一旦被冲开，要立即熄灭沼气池附近的烟火，以免引起火灾。
（三）加料入沼气池时，如数量较大，应打开开关，慢慢地加入。一次出料较多，压力表的水柱下降到接近“0”时，应打开开关，以免产生负压，损坏池子。
三、安全用气
（一）使用沼气时，要先点燃引火物，再扭开关：先开小一点，待点燃后才全部扭开。以防一时沼气放出过多，烧到身体，或引起火灾。
（二）沼气灯、炉具和输气管，不能靠近柴草等易燃物品设置，以防失火。一旦发生火灾，应立即关住开关，切断气源。
（三）禁止在沼气池导管口和出料口点火，以免引起回火，炸坏池子。
（四）如在室内闻到臭皮蛋气味时，应迅速打开门窗或扇风、鼓风，将沼气排出室外。这时，千万不能使用火柴、油灯、蜡烛、打火机等明火，以防引起火灾。当臭皮蛋气味完全消失后，才可使用明火。
四、安全出料、检修
（一）下池出料、检修，一定要做好安全防护措施。揭开活动盖后，要先出掉池内一部分料液，使进料口、出料口、活动盖口三口都通风，或用鼓风的办法迅速排出池内的残存气体。然后用小动物（青蛙、鸡、鸭、兔等）放入池内，观察10-15分钟，如动物活动正常，方可入池。如出现异常反映，甚至昏迷，表明池内严重缺氧或有残存的有毒气体，这时，严禁人进入池内。有条件的地方，提倡使用机具出粪，人不下池，既方便，又安全。对停用多年的沼气池进池出料更要特别注意，因为在池内粪壳和沉渣下面还积存有一部分沼气。如麻痹大意，轻率下池，不按安全操作规程办事，很有可能发生窒息中毒事故。
（二）下池人员腋下要拴上牢固结实的安全绳，池外要有精强力壮的人看护。一旦下池人员有头晕、发闷等不舒适的感觉，看护人员要立即拉安全绳，将人救出池外。
（三）揭开活动盖时，不要在沼气池周围点火吸烟。进池、出料、维修，只能使用手电筒照明或镜子反光照明，禁止使用明火。
（四）禁止向池内丢明火、烧余气，防止失火、烧伤或引起池子爆炸。