学校的医疗保险报销流程:
1.大学生在住院实行定点医疗（急诊住院除外），定点医院由各院校在基本医疗保险定点医疗机构范围内合理确定。大学生凭医疗保险经办机构印制的住院结算凭证就医，发生的符合医保规定的住院医疗费用，由定点医疗机构记账后，向所在区县医疗保险经办机构申报结算。
2.大学生在外省市发生急诊住院，或因病等休学期间需要在外省市住院医疗时，应到所在地的医疗保险定点医疗机构就医。发生的医疗费用由其本人垫付后，在出院或治疗后6个月内，由院校统一到医疗保险经办机构申请报销。
3.大学生在普通门诊实行院校医务部门就诊和转诊医疗。大学生经院校转诊在医保定点医疗机构发生的门诊医疗费用、在或外省市因急诊发生的医疗费用，以及因病等休学期间在外省市发生的普通门急诊医疗费用，由其本人垫付后，回院校按规定报销。
法律依据：
《中华人民共和国社会保险法》 第二十三条 职工应当参加职工基本医疗保险，由用人单位和职工按照国家规定共同缴纳基本医疗保险费。无雇工的个体工商户、未在用人单位参加职工基本医疗保险的非全日制从业人员以及其他灵活就业人员可以参加职工基本医疗保险，由个人按照国家规定缴纳基本医疗保险费。