在武汉深入一线探索，运用中医药诊治患者的过程中，张伯礼感触很深，对于如何加强中医药防治疫病也有了更深的思考。
他直面问题，“第一，虽然中医有了定点医院，但数量及床位仍较少，缺乏系统全面的中医诊疗体系;第二，中医药诊疗方法的顶层设计有待完善，临床诊疗和研究力量的协同性需要优化，形成综合性力量;第三，对中医药的偏见或者说是信心不足还是存在，包括一些患者、医生及管理人员，中医药在非中医院的使用有待推进。”
他总结经验和教训，“第一，我们不但要整理归纳中医药对新冠肺炎的临床疗效，更要做理论层面的思考。例如此次新冠肺炎以湿邪为主，潜伏期较长，病情发展相对温和，但又存在病情突然加重现象。这些都符合湿性黏腻、重浊持久的特点;同时湿邪易转化，可以化火化毒，所以我们在中医理论方面应该有所创新。第二，在体制机制方面，国家和各地区发布了很多中医诊疗方案，符合因地制宜的原则，但也需要中医在第一时间介入防治工作，掌握临床数据，研究归纳疾病的证候规律，基于证候变化特点优化中医诊疗方案就会更有临床指导性。第三，应该成建制地组建医疗队，设置更多的中医定点医院，以后一旦有新发的传染病疫情，中医应该尽早成建制介入。此次疫情中医虽然与SARS时相比参与得更早，但还是晚了一些，以后有类似情况中医一定要早介入，这也需要制度方面的保障。”