网上可以办理港澳通行证。网上办港澳通行证流程是:打开所属市的公安局出入境便民网。在个人业务中,已有通行证的,申请往来港澳个人旅游签注应点击已有通行证,然后进入申请协议书页面,阅读申请协议书后选择接受。根据自己的实际情况填完个人信息,最后确认提交,提交后等快递来取港澳通行证。