生理性卵巢囊肿：不影响
卵巢囊肿分为生理性卵巢囊肿和病理性卵巢囊肿，通常生理性卵巢囊肿会随着月经周期的激素变化而变化，异常量的液体聚集在滤泡内或黄体内，形成滤泡囊肿或黄体囊肿，通常在月经后或者三个月内自行消失，也不会对女性的月经造成影响。
病理性卵巢囊肿：可能会影响
如果是病理性卵巢囊肿，可能会引起月经紊乱。
月经是子宫内膜充血脱落的过程，而有的子官出血并不属于内分泌性，或因卵巢囊肿使盆腔的血管分布改变，引起子宫内膜充血而起;或由于卵巢恶性囊肿直接转移至子宫内膜所致。因内分泌性肿瘤所发生的月经紊乱常合并其他分泌影响。