畸胎瘤的大小决定其对人体的影响，比如纵膈畸胎瘤一般长几厘米大小时人体不会有知觉，只有超过了10厘米以上，对周围的器官或组织造成了一定的压迫或牵拉时才会出现疼痛，患者才能自知。
压迫神经还有部分患者的畸胎瘤长在可脑部，而颅内的空间十分有限，并且神经十分发达，在颅内的畸胎瘤很容易压迫神经，引起头晕、头痛。另外，肿瘤过大，也会引起颅内压增高，也会出现疼痛的症状。
畸胎瘤破裂畸胎瘤是一个囊性的肿瘤，在外层有一层黏膜包裹，但有些畸胎瘤生长过快，或者体积过大，就有破裂的可能，内容物外流，还可能引起内出血，出现畸胎瘤疼痛正常的症状之一。
卵巢胀痛畸胎瘤最常见的生长位置就是女性卵巢，若是生长在卵巢或输卵管内，生长在一定的大小后就会出现局部的胀痛，若不及时切除，还可能出现输卵管炸裂，引起内出血，出现疼痛加重。
畸胎瘤恶化畸胎瘤99%属于良性，但也有极少数会出现恶化的现象，畸胎瘤一旦恶化，生长速度会明显加快，疼痛感也会逐渐出现加重，严重甚至出现多处转移，多处疼痛。