1、含义不同：别墅是人类居住的终极理想与最高形式。是除了居住之外用来享受生活的居所，通常是独门独户独院的，由一栋独立建筑或多栋建筑组成。占地面积比较大，还设有私家花园。复式楼指的是上下两层具有相同层高，位于一个套间内的房型或建筑。层高的定义是国家制订的而非由开发商自行定义的。
2、价格区别：对于工薪阶层来说，购买复式房屋的压力会更小一些，毕竟复式房屋的面积有限，而且生活设施也要比别墅薄弱一点，毕竟和别墅还是有区别的，总价一般在90万元到200万元之间，是要比别墅地出来很多的，而别墅的价格越来越贵了，而且别墅在建造的时候会受到越来越多的约束，往往一套别墅的价格在三百万以上，购买压力更大。
3、功能区别：别墅在设计空间功能的时候更倾向于纵向化的设计，而且每一层的空间都是一个独立的个体，对于业主的隐私性保护是非常的完善的。别墅的设施是非常全面的，有自己的庭院，也有自己的一方土地，周边的生活环境更接近大自然一些。复式房屋的功能更多的是别墅空间的复制和缩影，为了能够满足空间需求，复式房屋的空间面积一般都是在180平米左右，少了庭院这一部分能够减少很多的开支，也更符合上班族的需要。复式房屋的面积随着时间的发展变得可大可小，和别墅相比较当然还是比较小的，所以有一些空间的划分还是很难做的清楚明了的，隐私性就不如别墅做的好了。
1、综合造价降低。户内隔层为木结构，将隔断、家具、装饰融为一体，既是墙，又是楼板、床、柜，降低了综合造价。
2、更加个性化的私人设计。通过对室内空间的再设计、再分割，可以融入更多的创意体现个性。在实际的设计中就有下层全部为家庭娱乐中心、而上层全部为非待客区域的设计，十分富有个性。
3、平面利用系数高。通过夹层复合，可使住宅的使用面积提高50—70%。简单的说，这是一种“向高度要空间”的设计思路。
4、土地利用率提高。上部夹层采用推拉窗及墙身多面窗户，通风采光良好，与一般层高和面积相同的住宅相比，土地利用率可提高40%。因此复式住宅同时具备了省地、省工、省料的特点。