1、正品果实呈卵圆形或椭圆形，两端略尖。表面灰黑色或灰棕色，平滑。果皮极坚硬，砸碎果皮后，可见椭圆形种子一粒，种皮红棕色。苦石莲的种子呈长圆形，两端钝圆。表面乌黑色或棕黑色，有光泽和细密的环状横纹。有长圆形种子一粒，种皮黄白色或淡棕色。
2、石莲子为睡莲科植物Nelumbo mucifera Gaertn的成熟果实，别名甜石莲。其伪品主要为豆科植物喙荚云实Caesal pinia minax Hance的干燥成熟种子，又名苦石莲。其大小外形很相似。